溫州醫(yī)學院基因組醫(yī)學研究院孫中生課題組2013年考研調(diào)劑信息

高校名稱 溫州醫(yī)科大學 所在省市 浙江
調(diào)劑專業(yè) 生物信息學、生物物理學、計算機等 是否有公費名額 未知
發(fā)布時間 2013-03-17 截止時間 未注明

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一、溫州醫(yī)學院基因組醫(yī)學研究院簡介

根據(jù)國家戰(zhàn)略需求和國際學科的發(fā)展趨勢,溫州醫(yī)學院于2009年3月22日成立了基因組醫(yī)學研究院(genomics.wzmc.edu.cn),旨在從功能基因組和表觀基因組水平上研究復雜疾病發(fā)生發(fā)展的遺傳基礎(chǔ)和表觀遺傳機制,以及在疾病形成過程中,遺傳和環(huán)境之間的交互作用,以期為提高我國疾病防控能力、提高人民健康水平、促進醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)發(fā)展做出基礎(chǔ)性、戰(zhàn)略性和前瞻性的貢獻。本院將依托于有良好樣本資源、病理診斷技術(shù)先進的溫州醫(yī)學院及其附屬醫(yī)院,有效地整合并擴大溫州醫(yī)學院現(xiàn)有的疾病樣本資源,建立起國內(nèi)一流的生物樣本收集庫,并對這些樣本進行深入、全面地全基因組相關(guān)分析和表觀基因組學分析,建立起基于學校,面向全國開放的功能基因篩選平臺、表觀遺傳學平臺、轉(zhuǎn)基因模式動物構(gòu)建平臺。并且,我們研究院借助新一代高通量測序技術(shù),開展全基因組(包括基因組、轉(zhuǎn)錄組、microRNA、DNA甲基化)相關(guān)生物信息學分析和深入挖掘,已經(jīng)在國際著名期刊發(fā)布論文(生物信息學軟件、webserver以及數(shù)據(jù)庫)數(shù)篇。正準備搭建全基因組相關(guān)信息分析的整合平臺,為基因組信息全面、準確、方便以及系統(tǒng)的分析打下基礎(chǔ),為人類基因組的臨床應(yīng)用提供工具支持和技術(shù)保障。基因組醫(yī)學研究院實行開放的、與國際接軌的管理體制和運行模式,加強與國內(nèi)外大學及研究中心的合作,力爭建設(shè)成為能夠承擔國家重大科研任務(wù)和國際合作項目的重要技術(shù)支撐平臺!

 孫中生博士,溫州醫(yī)學院基因組醫(yī)學研究院院長。1982年于北京大學獲得學士學位,1992年于美國德克薩斯州A&M大學獲得博士學位,1993-1994年在德克薩斯州大學安德生癌癥研究中心從事博士后研究,1994-1998年在美國貝勒醫(yī)學院分子人類遺傳學系從事博士后研究,1998-1999年任路易斯安那州立大學神經(jīng)學中心助理教授、主任助理,并任生物化學和遺傳系助理教授,1999-2005年任美國康奈爾大學助理教授、威爾醫(yī)學院特護醫(yī)學實驗室主任。主要研究方向為外周組織振蕩器的生物鐘基因在生理節(jié)律不同階段的特定表達;免疫生理節(jié)奏的分子機制;研究生物鐘基因mPer2如何調(diào)節(jié)學習和記憶行為。孫中生博士發(fā)現(xiàn)了哺乳動物關(guān)鍵的生物鐘基因—mPer1和mPer2,該發(fā)現(xiàn)揭示了哺乳動物生物鐘的分子生物學基礎(chǔ),文章發(fā)表國際權(quán)威的《CELL》雜志上,并被《Science》評為1997年度十大科學突破。到目前為止,發(fā)表的十三篇生物學方面的研究論文,被他人引用了1400多次。近幾年開始從事表觀基因組學研究,成功預(yù)測了基因組上所有的DNA甲基化功能區(qū)序列,運用自主研發(fā)的9K CGI芯片對惡性腫瘤、出生缺陷等疾病進行了大規(guī)模的DNA甲基化修飾研究,并且運用9K CGI芯片和Bisulfite測序?qū)Σ煌募谆疍NA富集技術(shù)進行了系統(tǒng)的評價。

 吳金雨博士,溫州醫(yī)學院基因組醫(yī)學研究院研究組長(PI)。吳金雨博士長期從事基因組信息學研究,迄今已在已在Nucleic Acid Research、Bioinformatics、BMC Bioinformatics、BMC Genomics和Genomics等國際權(quán)威雜志以第一作者或通訊作者身份發(fā)表SCI論文20余篇,并曾多次被Nucleic Acid Research,Bioinformatics,Journal of Molecular Evolution和PLoS ONE等雜志邀請作為其審稿人。已經(jīng)成功開發(fā)了一系列高度整合的比較基因組學分析平臺,包括proTF,ArchaeaTF,cTFbase,PlasmoGF和FlyPhy等。隨著新一代測序技術(shù)應(yīng)用的不斷拓展和帶來的機遇和挑戰(zhàn),已經(jīng)成功開發(fā)了新一代測序數(shù)據(jù)分析工具PGA4genomics,mirTools,MagicViewer,SplicingViewer,Exome-assistant,RRBS-analyser,mirTools 2.0,iMethy等。

二、實驗室環(huán)境和設(shè)備

 溫州醫(yī)學院基因組醫(yī)學研究具備分子生物學和生物信息學順利開展的所有硬件。分子生物學研究實驗器材方面,擁有毛細管測序儀、2D蛋白質(zhì)電泳儀、流式細胞儀、激光共聚焦顯微鏡、離心機、電泳儀、凝膠成像系統(tǒng)等。生物信息學方面,擁有HP C7000刀片超級計算服務(wù)器、HP 570G3超級大型服務(wù)器以及曙光大型服務(wù)器。該系統(tǒng)共有40個計算節(jié)點 (600個CPU),2個I/O節(jié)點,1個胖節(jié)點(120G),1個容錯節(jié)點,2臺NAS存儲。目前,研究組成員在算法、程序代碼編寫方面都積累了豐富的經(jīng)驗,能夠勝任Perl、PHP、MySQL、JAVA、Ajax和C++腳本的編寫,為數(shù)據(jù)分析工作和數(shù)據(jù)庫整合平臺的搭建提供了保障。

三、調(diào)劑條件及錄取后待遇

(1)調(diào)劑名額:生物信息學3名;
(2)必須過A區(qū)國家線;
(3)有一定的計算機編程基礎(chǔ)或者對生物信息學具有很濃厚的興趣;
(4)3個名額都是公費;
(5)學校與導師每月給予學生的生活補助不低于1000元;
(6)學校還為品學兼優(yōu)的學生提供以各類獎學金,其最高金額可達兩萬元;
(7)每年有1-2名提前攻博的機會。

四、接收調(diào)劑專業(yè)

生物信息學、生物物理學、計算機、數(shù)學、生物等相關(guān)學科

五、聯(lián)系方式

Email:wzmcgenomics@163.com

請將詳細簡歷以郵件正文形式和word附件一起發(fā)于上述郵箱,并留下聯(lián)系電話, 我們經(jīng)過初篩后會給予及時回復。

溫州醫(yī)學院基因組醫(yī)學研究院孫中生課題組

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